MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-05

Total Repeats: 207

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005004	AGA	2	6	10	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005004	ATAC	2	8	17	24	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005004	AT	3	6	60	65	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005004	AAT	2	6	72	77	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005004	AAT	2	6	81	86	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005004	AAC	2	6	92	97	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005004	ATC	2	6	118	123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005004	A	7	7	124	130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005004	GT	3	6	153	158	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005004	GAA	2	6	499	504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005004	CAA	2	6	2292	2297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_005004	TG	3	6	2366	2371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005004	AGG	2	6	2385	2390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005004	TAT	2	6	2411	2416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005004	CAA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_005004	AAG	2	6	2441	2446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005004	TAG	2	6	2490	2495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005004	TAT	2	6	4332	4337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005004	TA	3	6	4340	4345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005004	AGT	2	6	4347	4352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005004	ATT	2	6	4377	4382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005004	AT	8	16	5272	5287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005004	TTA	2	6	5288	5293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005004	T	6	6	5298	5303	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005004	ATT	2	6	5306	5311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005004	ATA	3	9	5337	5345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005004	TAG	2	6	5373	5378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005004	A	7	7	5393	5399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005004	AT	3	6	5425	5430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005004	GAA	2	6	5480	5485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005004	GAA	2	6	5528	5533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005004	A	6	6	5555	5560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005004	AAG	2	6	5564	5569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005004	AAT	2	6	5573	5578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005004	A	7	7	5586	5592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005004	TGA	2	6	5593	5598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005004	TA	3	6	5612	5617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005004	CAA	2	6	5623	5628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005004	AGAA	2	8	5656	5663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005004	TAA	2	6	5686	5691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005004	GAAAA	2	10	5708	5717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005004	ATA	2	6	5726	5731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005004	A	8	8	5748	5755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005004	AG	3	6	5810	5815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005004	A	7	7	5844	5850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005004	TCA	2	6	5887	5892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_005004	TTTTTA	2	12	5895	5906	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005004	AAT	2	6	5920	5925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005004	ACC	2	6	5937	5942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_005004	GGT	2	6	5953	5958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005004	GTCA	2	8	6013	6020	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_005004	ACT	2	6	6026	6031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_005004	T	7	7	6061	6067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005004	T	7	7	6072	6078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005004	TCT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005004	TTC	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_005004	CTAC	2	8	6188	6195	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_005004	CTAT	2	8	6226	6233	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_005004	ATT	2	6	6272	6277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005004	CAA	2	6	6303	6308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005004	ATG	2	6	6312	6317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005004	ATATGA	2	12	6347	6358	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005004	TAT	2	6	6379	6384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005004	CTT	2	6	6399	6404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_005004	ATA	2	6	6424	6429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005004	ATA	2	6	6431	6436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005004	AT	3	6	6986	6991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005004	ATT	2	6	6996	7001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005004	A	6	6	7018	7023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005004	TGA	2	6	7061	7066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005004	TAT	2	6	7091	7096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005004	T	6	6	7103	7108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005004	TA	3	6	7110	7115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005004	AAAT	2	8	7148	7155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005004	ATA	2	6	7163	7168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005004	CAA	2	6	7207	7212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005004	GAT	2	6	7228	7233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005004	TATT	2	8	7239	7246	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005004	CAT	2	6	7395	7400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_005004	TTAA	2	8	7469	7476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005004	TAT	2	6	7491	7496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005004	ATTTTT	2	12	7519	7530	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005004	T	8	8	7526	7533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005004	TTTA	2	8	7558	7565	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005004	AGC	2	6	7579	7584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_005004	T	6	6	7600	7605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005004	TAATT	2	10	7622	7631	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005004	TGT	2	6	7682	7687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005004	T	6	6	7693	7698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005004	TAT	2	6	7737	7742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005004	ATC	2	6	7831	7836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_005004	T	7	7	7851	7857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005004	TTA	2	6	7865	7870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005004	T	8	8	8008	8015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005004	CAATTA	2	12	8076	8087	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_005004	AAT	2	6	8147	8152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005004	TAT	2	6	8183	8188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005004	AAG	2	6	8199	8204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005004	ATA	2	6	10360	10365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005004	TTA	2	6	10389	10394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005004	TAA	2	6	10407	10412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005004	AT	3	6	10421	10426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005004	T	6	6	10474	10479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005004	GTAT	2	8	10492	10499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005004	CAA	2	6	10526	10531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005004	A	6	6	10530	10535	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005004	TA	3	6	10585	10590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005004	AAATTT	2	12	10642	10653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005004	AT	3	6	13485	13490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005004	AAGTA	2	10	13492	13501	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005004	CT	3	6	13524	13529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_005004	T	6	6	13590	13595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005004	A	6	6	13605	13610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005004	TA	3	6	13611	13616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005004	T	6	6	14738	14743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005004	CAA	2	6	14803	14808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_005004	TGA	2	6	14818	14823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005004	CCT	2	6	14866	14871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_005004	CT	3	6	14870	14875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_005004	GA	3	6	14895	14900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005004	TATAT	2	10	14912	14921	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005004	ATA	2	6	14938	14943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005004	TAAAA	2	10	14983	14992	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005004	TTAT	2	8	16252	16259	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005004	AGA	2	6	16295	16300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005004	ATG	2	6	16305	16310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005004	ATC	2	6	16391	16396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_005004	TAT	2	6	16420	16425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005004	A	7	7	16433	16439	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005004	TAC	2	6	16466	16471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_005004	AT	3	6	16473	16478	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005004	ACT	2	6	16485	16490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_005004	TTAAA	2	10	16513	16522	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005004	A	6	6	16555	16560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005004	ACTTT	2	10	16614	16623	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_005004	T	6	6	16632	16637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005004	TGA	2	6	16656	16661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005004	ATG	2	6	16690	16695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005004	T	6	6	16732	16737	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005004	ATG	2	6	16790	16795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005004	T	6	6	16810	16815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005004	ATC	2	6	16848	16853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_005004	TTCA	2	8	16908	16915	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_005004	A	7	7	16932	16938	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005004	A	6	6	16956	16961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005004	T	6	6	16965	16970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005004	GCTC	2	8	16972	16979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_005004	ATTG	2	8	16989	16996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005004	T	6	6	17000	17005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_005004	AC	3	6	17027	17032	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_005004	AT	3	6	17056	17061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_005004	A	6	6	17064	17069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_005004	CA	3	6	17074	17079	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_005004	T	6	6	17080	17085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_005004	T	7	7	17101	17107	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_005004	T	6	6	17121	17126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_005004	T	7	7	17147	17153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_005004	TAAAA	2	10	17190	17199	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_005004	T	6	6	17291	17296	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_005004	T	6	6	17313	17318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_005004	CGCT	2	8	17415	17422	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_005004	T	6	6	17527	17532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_005004	TGTT	2	8	17655	17662	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_005004	T	6	6	17661	17666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_005004	GAT	2	6	17670	17675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_005004	GTTC	2	8	17676	17683	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
167	NC_005004	A	7	7	17684	17690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_005004	AGG	2	6	19337	19342	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
169	NC_005004	ATT	2	6	19387	19392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_005004	ATC	2	6	19404	19409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_005004	ATT	2	6	19413	19418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_005004	CAA	2	6	19423	19428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_005004	CTT	2	6	20001	20006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_005004	TAA	2	6	20912	20917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_005004	TA	3	6	20994	20999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_005004	TCG	2	6	21536	21541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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179	NC_005004	TTC	2	6	21560	21565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_005004	CAAT	2	8	21573	21580	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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183	NC_005004	AC	3	6	21729	21734	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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186	NC_005004	AAC	2	6	21825	21830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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188	NC_005004	TAT	2	6	21860	21865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_005004	CCT	2	6	21894	21899	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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192	NC_005004	CATA	2	8	22019	22026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
193	NC_005004	GTC	2	6	22066	22071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
194	NC_005004	CAAAAC	2	12	22155	22166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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199	NC_005004	C	6	6	23309	23314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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201	NC_005004	G	7	7	23332	23338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
202	NC_005004	TAA	2	6	23343	23348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.